1996年10月21日，自治区科协召开第五次代表大会。大会通过了《新疆维吾尔自治区科学技术协会章程》修改报告，决定《新疆维吾尔自治区自然科学专门学会组织工作条件》由五届委员会审议颁布实施。大会选举161名委员组成自治区科协五届委员会。五届一次全委会议选举41名常务委员组成常务委员会，选举主席1人，副主席13人，秘书长1人。
1998年，根据自治区党委机构改革领导小组批准自治区科协机构改革方案，自治区科协机关职能工作设6个部门，事业单位设7个部门。自治区科协机关迁至乌鲁木齐市北京南路2号科技大厦办公。
自治区科协五届委员会
主席、副主席、秘书长
职 务 姓 名 任职时间
主 席 许 鹏 1996年10月～2002年05月
副主席 胡吉汉·哈克莫夫 1996年10月～2002年05月
伯塔依·库平 1996年10月～1999年07月
沙迪尔·卡德尔 1996年10月～2002年05月
张曰知 1996年10月～2002年05月
魏柳根 1996年10月～1999年09月
何宏应 1996年10月～2002年05月
周俊林 1996年10月～2002年05月
张良臣 1996年10月～2002年05月
阿不都热依木·阿不都克里木 1996年10月～2000年04月
马合苏提·库买克 1996年10月～2000年04月
塔西甫拉提·特依拜 1996年10月～2002年05月
哈米提·哈凯莫夫 1996年10月～2002年05月
洪秀芳 1996年10月～1998年06月
秘书长 马 平 1996年10月～2002年05月
魏生贵 1996年10月～2002年05月
正厅级调研员 阿巴斯·包尔汉 1996年10月～1997年09月
副厅级调研员 杨永青 1996年10月～2001年10月
刘旦生 1996年10月～2001年06月
常 务 委 员
阿不都热依木·阿不都克里木 艾尔肯·吐尼牙孜 伯塔依·库平 塔西甫拉提·特依拜
张良臣 张淑兰 张绚邦 张万生 张日知 赵 峡 周俊林 哈米提·哈凯莫夫 洪秀芳
胡吉汉·哈克莫夫 何宏应 沙迪尔·卡德尔 邵立山 许 鹏 徐庆怡 熊开湘 高祥生
吕发科 李君义 刘旦生 刘晏良 卢守强 罗真权 马 平 马哈苏提·库买克
维纳汗·巴彦 王树清 王德贤 魏柳根 司马义·哈提甫 司马义·依不拉音
伊马木·日幕图拉 杨永青 于努斯·玉素甫 刘景奎 赵保军 魏生贵
委 员
阿巴斯·玉素甫 阿不都热依木·阿不都克里木 阿布拉·肉孜 阿不力克木·艾买提
阿不力克木·阿吉 阿勒腾拜 安尼瓦尔 艾尔肯·吐尼牙孜 伯塔依·库平
白克力·乌麻尔 帕尔哈特 裴安明 浦承源 塔什买买提 塔西甫拉提·特依拜 汤铁山
塔依尔·斯拉甫力 塔依尔·吐尔逊 吐拉宏 托乎提·巴克 托 曼 田浚仁 张大铭
张汉东 张荷观 张 晋 张良臣 张茂信 张淑兰 张万生 张绚邦 张咏南 张日知
赵 峡 周俊林 朱令人 居来提·卡德尔 朱新安 朱玛汉 周国光 甄 鹏 郑建民
郑仁侠 贾钧山 解 放 井植朴 景学清 庄才庆 陈俊斌 陈 彤 陈为祥 陈文海
陈震东 曲庆林 哈米提·哈凯莫夫 海 鹰 何佛元 何宏应 洪连忠 洪秀芳
胡吉汉·哈克莫夫 胡勇志 黄培佑 邓艳华 丁巧玲 董战武 热夏提·斯迪克
热依汗 邹 渝 孜来汗·赛提尼牙孜 曾庆博 沙迪尔·卡德尔 曹国琴 崔俊南
司马义·哈提甫 宋郁东 司马义·伊不拉音 孙玉柏 邵立山 许 鹏 施 敏 石玉瑚
萧 英 熊大鹏 熊开湘 徐庆怡 徐 舫 哈力甫·司马义 哈帕尔·艾山 冯东明
亢冰雁 坎吉别克·阿克巴尔 高鸿庆 高祥生 高学兵 甘蜜蜜 顾锦章 吕发科
古丽孜帕·努尔木哈买提 葛菊芬 喇秀花 李贵环 李健智 李 军 李君义 李 平
李树贤 李霞飞 李延龄 刘景奎 刘旦生 刘素芸 刘燕宁 刘志翼 刘晏良 卢守强
罗真权 马 平 马 恰 马合苏提·库买克 买买提·阿西木 买买提明·胡达别尔地
买买提明·沙比尔 莫合买提·热依木 孟 征 木沙·克里木 牛树华 努素甫·艾力
阿比孜·克里木 依达也提·提拉 王树清 维纳汗·巴彦 王 兴 王德贤 王国光
王洪礼 王庆贵 王士生 王维基 王伟国 武 新 魏柳根 伊力亚斯·米尔哈西木
伊马木·日幕图拉 伊明·米满夏 叶尔夏提·马力克 杨承时 杨 峰 杨贵斌 杨 军
杨俊鹏 杨 森 杨永皆 杨永青 姚源松 阎恩富 严荣良 严以绥 于素甫·阿米提
赵保军 玉素甫·吾甫尔 于努斯·玉素甫 魏生贵
自治区科协五届一次全委会议授予自治区科协荣誉委员的决定
（1996年10月23日）
根据《新疆维吾尔自治区科学技术协会章程》和五届一次全委会议讨论通过，决定授予那吉米丁·尼扎木丁（维吾尔族）、刘守仁、许秀华（女）、米吉提·胡达拜尔地（维吾尔族）四位同志荣誉委员称号。
中共自治区科协党组
职 务 姓 名 任职时间
党组书记 魏柳根 1996年10月～1999年9月
赵保军 1996年10月～2002年5月
党组副书记 李君义 1996年10月～2002年5月
党组成员 魏柳根 1996年10月～1999年9月
赵保军 1996年10月～2002年5月
李君义 1996年10月～2002年5月
阿不都热依木·阿不都克里木 1996年10月～2000年4月
马合苏提·库买克 1996年10月～2000年4月
居来提·卡德尔 2002年05月～2004年4月
贾合亚·艾斯砍的尔 2000年04月～2002年5月
马 平 1996年10月～1998年6月
魏生贵 1998年06月～2002年5月
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